CAELinux 2013: development and testing

  • Joël Cugnoni
  • Joël Cugnoni's Avatar Topic Author
  • Offline
  • Moderator
  • Moderator
More
10 years 11 months ago - 10 years 11 months ago #6884 by Joël Cugnoni
Replied by Joël Cugnoni on topic Re: CAELinux 2013: development and testing
Hello everybody,

development is progressing fairly well. A few days ago, I have finalized a first testing version of Code-Saturne 3.0 package with MPI / PTScotch support (no Syrthes coupling yet). And today I have just finished the first package for Calculix 2.5 (multithreaded version !!).

Both packages are thus available for testing on sourceforge.

As a reminder for those of you who would like to test these packages before release of CAELinux 2013 or if you have already an installation of Ubuntu 12.04 amd64 (or one of its derivative), this is the procedure to follow to access those packages:


1) add one of the following line to /etc/apt/sources.list by running sudo -e /etc/apt/sources.list
deb http://kent.dl.sourceforge.net/project/caelinux 2013 testing
    or
  deb http://switch.dl.sourceforge.net/project/caelinux 2013 testing

2) update your package lists with sudo apt-get update

3) install external sources used by caelinux packages

sudo apt-get install caelinux-apt-sources

4) update the package list a last time

sudo apt-get update

5) install your caelinux packages using

sudo apt-get install name-of-the-package

The current list of package names is shown below:

SALOME-MECA-2013.1-LGPL
builddeb
caelinux-apt-sources
calculix-2.5-mt-caelinux
code-aster-11.3-mpi
code-saturne-3.0-mpi-caelinux
discretizer
elmerfem-caelinux
helyx-os
openblas-caelinux
openfoam211-caelinux
openfoam220-caelinux
paraviewopenfoam3120-caelinux

Joël Cugnoni - a.k.a admin
www.caelinux.com
Last edit: 10 years 11 months ago by Joël Cugnoni.

Please Log in or Create an account to join the conversation.

More
10 years 11 months ago - 10 years 11 months ago #6888 by John Hazel
Replied by John Hazel on topic Re: CAELinux 2013: development and testing
I'm still working on getting a non-buggy install of Xbuntu 12.04.2 here.
I have dual screens (both 1920x1200) on Radeon 4870.
12.04 is misbehaving on the exact machine that CAElinux 2011 worked flawlessly.

I even re-installed with my CAE2011 cd to be sure the hardware is ok.
All that was needed was to go to system>preferences>monitors then unclick "same image in all monitors" and the system is completely setup with a 3840x1200 extended desktop.

12.04.2 has hitches as I move the cursor from monitor to monitor.
Installing the catalyst driver in 12.04.2 results in not being able to uncheck the "same image in all screens" because catalyst admin wont even open.

edit:
The A10-5800k system has a single screen. I installed 12.04.2 from a separately downloaded ISO and it is still buggy too. Right now SALOME-MECA-2013.1-LGPL is installing . It is downloading at onlt 130kb/s and reports 2 more hours to go.

edit 2:
Using your list in the previous post all packages see to have installed without error. Tomorrow I will try running what I can.
Last edit: 10 years 11 months ago by John Hazel. Reason: update to post install

Please Log in or Create an account to join the conversation.

More
10 years 11 months ago - 10 years 11 months ago #6906 by dutchtallman
Replied by dutchtallman on topic Re: CAELinux 2013: development and testing
Salome-meca installs well and doing simple stuff in salome-meca works fine, doing all within Salome-Meca, including Calculating with aster, using the "run" button in salome.

However, caelinux is also planning to include code_aster as stand_alone, while it is already shipped with salome_meca
so I tried to run the Code-aster self tests on Code_aster that is shipped with "SALOME-MECA-2013.1-LGPL"

sources and reference for the test:
www.code-aster.org/V2/IMG/html/README_aster-11.html
www.code-aster.org/V2/IMG/html/README_as...st-your-installation

commands used:
cd /opt/SALOME-MECA-2013.1/SALOME-MECA-2013.1-LGPL/tools/Code_aster_standalone_20131_public/bin 
cd ../STA11.3
sudo ../bin/as_run forma01a.export

should end with:
--- DIAGNOSTIC JOB : OK

but it does not, see terminal output below
I repeated the test for STA11, with similar result
it seems to be missing some platform independent libraries
See full terminal output, including suggestions from the run under "output 1"

I also tried it on my self-installed salome_meca...

commands used:
cd ~/System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/aster/bin 
cd ../STA11
sudo ../bin/as_run forma01a.export

and then the output runs fine, as can be seen under "output 2"

So to me, the CAElinux installation of salome_meca /code_aster is not OK yet...
But I lack suggestions where to improve here... output 1 provides some that I don't understand


dutchtallman



= start output 1 ==================================================================================

Code_Aster execution

<INFO> prepare environment in /tmp/root-HP-8540w-interactif.9342
adding a symbolic link /tmp/root-HP-8540w-interactif.9342/asteru to /opt/SALOME-MECA-2013.1/SALOME-MECA-2013.1-LGPL/tools/Code_aster_standalone_20131_public/STA11.3/asteru...
[ OK ]
adding a symbolic link /tmp/root-HP-8540w-interactif.9342/Python/Cata/cata.py to /opt/SALOME-MECA-2013.1/SALOME-MECA-2013.1-LGPL/tools/Code_aster_standalone_20131_public/STA11.3/commande/cata.py...
[ OK ]
copying .../STA11.3/elements... [ OK ]

Copying datas

copying .../astest/forma01a.comm... [ OK ]
copying .../astest/forma01a.mmed... [ OK ]
<INFO> Parameters : memory 512 MB - time limit 60 s

Content of /tmp/root-HP-8540w-interactif.9342 before execution

total 19328
drwx
5 root root 4096 May 12 12:49 .
drwxrwxrwt 25 root root 4096 May 12 12:49 ..
-rw-r--r-- 1 root root 847 May 12 12:49 9342.export
-rw-r--r-- 1 root root 47 May 12 12:49 9342.para
lrwxrwxrwx 1 root root 103 May 12 12:49 asteru -> /opt/SALOME-MECA-2013.1/SALOME-MECA-2013.1-LGPL/tools/Code_aster_standalone_20131_public/STA11.3/asteru
-rw-r--r-- 1 root root 1627 May 12 12:49 config.txt
-rw-r--r-- 1 root root 19660808 May 12 12:49 elem.1
-rw-r--r-- 1 root root 4171 May 12 12:49 fort.1.1
-rw-r--r-- 1 root root 78561 May 12 12:49 fort.20
drwxr-xr-x 21 root root 4096 May 12 12:49 Python
drwxr-xr-x 2 root root 4096 May 12 12:49 REPE_OUT
drwxr-xr-x 2 root root 4096 May 12 12:49 RESU_ENSIGHT


Code_Aster run

<INFO> Command line 1 :
<INFO> ./asteru Python/Execution/E_SUPERV.py -eficas_path ./Python -commandes fort.1 -rep_mat $ASTER_ROOT/STA11.3/materiau -num_job 9342 -mode interactif -rep_outils /opt/SALOME-MECA-2013.1/SALOME-MECA-2013.1-LGPL/tools/Code_aster_standalone_20131_public/outils -rep_dex /opt/SALOME-MECA-2013.1/SALOME-MECA-2013.1-LGPL/tools/Code_aster_standalone_20131_public/STA11.3/datg -suivi_batch -memjeveux 64.0 -tpmax 60
Could not find platform independent libraries <prefix>
Could not find platform dependent libraries <exec_prefix>
Consider setting $PYTHONHOME to <prefix>[:<exec_prefix>]
'import site' failed; use -v for traceback
Traceback (most recent call last):
File "Python/Execution/E_SUPERV.py", line 28, in <module>
import os
ImportError: No module named os
EXECUTION_CODE_ASTER_EXIT_9342=1
<INFO> Code_Aster run ended, diagnostic : NO_RESU_FILE

Content of /tmp/root-HP-8540w-interactif.9342 after execution

.:
total 19340
drwx
5 root root 4096 May 12 12:49 .
drwxrwxrwt 25 root root 4096 May 12 12:49 ..
-rw-r--r-- 1 root root 847 May 12 12:49 9342.export
-rw-r--r-- 1 root root 47 May 12 12:49 9342.para
lrwxrwxrwx 1 root root 103 May 12 12:49 asteru -> /opt/SALOME-MECA-2013.1/SALOME-MECA-2013.1-LGPL/tools/Code_aster_standalone_20131_public/STA11.3/asteru
-rw-r--r-- 1 root root 1627 May 12 12:49 config.txt
-rw-r--r-- 1 root root 19660808 May 12 12:49 elem.1
-rw-r--r-- 1 root root 4171 May 12 12:49 fort.1
-rw-r--r-- 1 root root 4171 May 12 12:49 fort.1.1
-rw-r--r-- 1 root root 78561 May 12 12:49 fort.20
-rw-r--r-- 1 root root 33 May 12 12:49 fort.6
drwxr-xr-x 21 root root 4096 May 12 12:49 Python
drwxr-xr-x 2 root root 4096 May 12 12:49 REPE_OUT
drwxr-xr-x 2 root root 4096 May 12 12:49 RESU_ENSIGHT

REPE_OUT:
total 8
drwxr-xr-x 2 root root 4096 May 12 12:49 .
drwx
5 root root 4096 May 12 12:49 ..


Size of bases


Copying results

copying .../fort.6... [ OK ]

<A>_COPYFILE no such file or directory: fort.8


<A>_COPYFILE no such file or directory: fort.9


NO_RESU_FILE Code_Aster run ended



cpu system cpu+sys elapsed
Preparation of environment 0.01 0.04 0.05 0.07
Copying datas 0.01 0.00 0.01 0.02
Code_Aster run 0.01 0.00 0.01 0.02
Copying results 0.00 0.00 0.00 0.01
Total 0.19 0.06 0.25 0.32

as_run 1.11.0

--- DIAGNOSTIC JOB : NO_RESU_FILE


EXIT_CODE=4

= end output 1 ==================================================================================


= start output 2 ==================================================================================

[OK] . /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/SALOME-MECA/V6_5_0/envSalomeMeca.sh
[OK] . /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/SALOME-MECA/V6_5_0/prerequis-ASTER.sh
[OK] . /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/SALOME-MECA/V6_5_0/prerequis-EFICAS.sh
[OK] . /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/SALOME-MECA/V6_5_0/prerequis-EUROPLEXUS.sh
[OK] . /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/SALOME-MECA/V6_5_0/prerequis-Plugins.sh
[OK] . /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/SALOME-MECA/V6_5_0/prerequis-salome-pyutils.sh

Checking... LD_LIBRARY_PATH
NO ! /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/SALOME/Salome-V6_5_0p1-OT-LGPL-x86_64/prerequisites/Metis_40/lib

Checking... PATH
NO ! /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/SALOME/Salome-V6_5_0p1-OT-LGPL-x86_64/prerequisites/Matplotlib_110/bin
NO ! /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/SALOME/Salome-V6_5_0p1-OT-LGPL-x86_64/prerequisites/Metis_40/bin
NO ! /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/SALOME/Salome-V6_5_0p1-OT-LGPL-x86_64/prerequisites/Gl2ps_135/bin

Checking... PYTHONPATH

Code_Aster execution

<INFO> prepare environment in /tmp/root-HP-8540w-interactif.16008
adding a symbolic link /tmp/root-HP-8540w-interactif.16008/asteru to /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/aster/testing/asteru...
[ OK ]
adding a symbolic link /tmp/root-HP-8540w-interactif.16008/Python/Cata/cata.py to /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/aster/testing/commande/cata.py...
[ OK ]
copying .../testing/elements... [ OK ]

Copying datas

copying .../astest/forma01a.comm... [ OK ]
copying .../astest/forma01a.mmed... [ OK ]
<INFO> Parameters : memory 64 MB - time limit 60 s

Content of /tmp/root-HP-8540w-interactif.16008 before execution

total 19328
drwx
5 root root 4096 May 16 11:23 .
drwxrwxrwt 18 root root 4096 May 16 11:23 ..
-rw-r--r-- 1 root root 717 May 16 11:23 16777.export
-rw-r--r-- 1 root root 46 May 16 11:23 16777.para
lrwxrwxrwx 1 root root 77 May 16 11:23 asteru -> /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/aster/testing/asteru
-rw-r--r-- 1 root root 7249 May 16 11:23 config.txt
-rw-r--r-- 1 root root 19660808 May 16 11:23 elem.1
-rw-r--r-- 1 root root 3990 May 16 11:23 fort.1.1
-rw-r--r-- 1 root root 78561 May 16 11:23 fort.20
drwxr-xr-x 21 root root 4096 May 16 11:23 Python
drwxr-xr-x 2 root root 4096 May 16 11:23 REPE_OUT
drwxr-xr-x 2 root root 4096 May 16 11:23 RESU_ENSIGHT


Code_Aster run

<INFO> Command line 1 :
<INFO> ./asteru Python/Execution/E_SUPERV.py -eficas_path ./Python -commandes fort.1 -num_job 16777 -mode interactif -rep_mat $ASTER_ROOT/testing/materiau -rep_outils /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/aster/outils -rep_dex /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/aster/STA11.2/datg -suivi_batch -memjeveux 8.0 -tpmax 60
#
# Impression du contenu du fichier de commandes à exécuter :
#
# MODIF DATE 05/03/2012 AUTEUR PELLET J.PELLET
# RESPONSABLE DELMAS J.DELMAS
# TITRE PLAQUE TROUEE EN TRACTION EN ELASTICITE
# CONFIGURATION MANAGEMENT OF EDF VERSION
# ======================================================================
# COPYRIGHT (C) 1991 - 2012 EDF R&D WWW.CODE-ASTER.ORG
# THIS PROGRAM IS FREE SOFTWARE; YOU CAN REDISTRIBUTE IT AND/OR MODIFY
# IT UNDER THE TERMS OF THE GNU GENERAL PUBLIC LICENSE AS PUBLISHED BY
# THE FREE SOFTWARE FOUNDATION; EITHER VERSION 2 OF THE LICENSE, OR
# (AT YOUR OPTION) ANY LATER VERSION.
#
# THIS PROGRAM IS DISTRIBUTED IN THE HOPE THAT IT WILL BE USEFUL, BUT
# WITHOUT ANY WARRANTY; WITHOUT EVEN THE IMPLIED WARRANTY OF
# MERCHANTABILITY OR FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. SEE THE GNU
# GENERAL PUBLIC LICENSE FOR MORE DETAILS.
#
# YOU SHOULD HAVE RECEIVED A COPY OF THE GNU GENERAL PUBLIC LICENSE
# ALONG WITH THIS PROGRAM; IF NOT, WRITE TO EDF R&D CODE_ASTER,
# 1 AVENUE DU GENERAL DE GAULLE, 92141 CLAMART CEDEX, FRANCE.
# ======================================================================
# forma01a.para = tps_job 60 mem_job 64Mo ncpus 1 liste_test R

DEBUT(CODE=_F(NOM='FORMA01A',
NIV_PUB_WEB='INTERNET',
VISU_EFICAS='OUI',),DEBUG=_F(SDVERI='OUI'))

MA=DEFI_MATERIAU(ELAS=_F(E=200000.0,
NU=0.3,),);

MAIL=LIRE_MAILLAGE(FORMAT='MED',);

MODE=AFFE_MODELE(MAILLAGE=MAIL,
AFFE=_F(TOUT='OUI',
PHENOMENE='MECANIQUE',
MODELISATION='C_PLAN',),);

MAIL=MODI_MAILLAGE(reuse =MAIL,
MAILLAGE=MAIL,
ORIE_PEAU_2D=_F(GROUP_MA='haut',),);

MATE=AFFE_MATERIAU(MAILLAGE=MAIL,
AFFE=_F(TOUT='OUI',
MATER=MA,),);

CHAR=AFFE_CHAR_MECA(MODELE=MODE,
DDL_IMPO=(_F(GROUP_MA='bas',
DY=0.0,),
_F(GROUP_MA='gauche',
DX=0.0,),),
PRES_REP=_F(GROUP_MA='haut',
PRES=-100.0,),);

RESU=MECA_STATIQUE(MODELE=MODE,
CHAM_MATER=MATE,
EXCIT=_F(CHARGE=CHAR,),);

RESU=CALC_ELEM(reuse =RESU,
RESULTAT=RESU,
OPTION=('SIGM_ELNO','SIEQ_ELNO','SIEQ_ELGA',),);

RESU=CALC_CHAMP(reuse =RESU,
RESULTAT=RESU,
CONTRAINTE='SIGM_NOEU',CRITERES='SIEQ_NOEU');

IMPR_RESU(FORMAT='MED',
UNITE=80,
RESU=_F(MAILLAGE=MAIL,
RESULTAT=RESU,
NOM_CHAM=('DEPL','SIGM_NOEU','SIEQ_NOEU','SIEQ_ELGA',),),);

TEST_RESU(RESU=(_F(RESULTAT=RESU,
NUME_ORDRE=1,
NOM_CHAM='SIGM_NOEU',
NOM_CMP='SIYY',
GROUP_NO='B',
VALE=303.0,
CRITERE='RELATIF',
PRECISION=0.05,
REFERENCE='ANALYTIQUE',),
_F(RESULTAT=RESU,
NUME_ORDRE=1,
NOM_CHAM='SIGM_NOEU',
NOM_CMP='SIYY',
GROUP_NO='B',
VALE=289.521225,
CRITERE='RELATIF',
PRECISION=1.E-7,
REFERENCE='NON_REGRESSION',),),);

TEST_RESU(RESU=(_F(RESULTAT=RESU,
NUME_ORDRE=1,
NOM_CHAM='SIGM_NOEU',
NOM_CMP='SIXX',
GROUP_NO='A',
VALE=-100.0,
CRITERE='RELATIF',
PRECISION=0.15,
REFERENCE='ANALYTIQUE',),
_F(RESULTAT=RESU,
NUME_ORDRE=1,
NOM_CHAM='SIGM_NOEU',
NOM_CMP='SIXX',
GROUP_NO='A',
VALE=-85.8814145,
CRITERE='RELATIF',
PRECISION=1.E-7,
REFERENCE='NON_REGRESSION',),),);

FIN();

#


-- CODE_ASTER -- VERSION : DÉVELOPPEMENT STABILISÉE (testing) --

Version 11.2.0 du 06/06/2012
Copyright EDF R&D 1991 - 2013
Exécution du : Thu May 16 11:23:49 2013
Nom de la machine : HP-8540w
Architecture : 64bit
Type de processeur : x86_64
Système d'exploitation : Linux 3.2.0-43-generic
Langue des messages : en (UTF-8)

Parallélisme MPI : inactif
Parallélisme OpenMP : actif
Nombre de processus utilisés : 1
Version de la librairie HDF5 : 1.8.8
Version de la librairie MED : 3.0.5
Librairie MUMPS : installée
Version de la librairie SCOTCH : 5.1.10

Limite de la mémoire dynamique : 64.00 Mo
Taille limite des fichiers d'échange : 48.00 Go


#
# Commande No : 0001 Concept de type : -
#
DEBUT(INFO=1,
CODE=_F(VISU_EFICAS='OUI',
NOM='FORMA01A',
NIV_PUB_WEB='INTERNET'),
PAR_LOT='OUI',
IMPR_MACRO='NON',
RESERVE_CPU=_F(BORNE=900),
MEMOIRE=_F(TAILLE_BLOC=800.0,
TAILLE_GROUP_ELEM=1000),
DEBUG=_F(JEVEUX='NON',
JXVERI='NON',
HIST_ETAPE='NON',
SDVERI='OUI'),
MESURE_TEMPS=_F(MOYENNE='OUI',
NIVE_DETAIL=1),
);


!
!
! <I> <SUPERVIS_22> !
! !
! Les mots-clés facteurs CODE et DEBUG dans DEBUT/POURSUITE sont réservés aux cas-tests. !
! Il ne faut pas les utiliser dans les études car ils modifient certaines valeurs par !
! défaut des commandes DEBUT/POURSUITE qui ont des conséquences sur le comportement !
! en cas d'erreur ou sur les performances. !
!
!


Débogage SDVERI demandé

Valeur initiale du temps CPU maximum = 60 secondes
Valeur du temps CPU maximum passé aux commandes = 50 secondes
Réserve CPU prévue = 10 secondes

Début de lecture


Réouverture de la base

Nom de la base : ELEMBASE
Créée avec la version : 11.02.00
Nombre d'enregistrements utilisés : 24
Nombre d'enregistrements maximum : 512
Longueur d'enregistrement (octets) : 819200
Nombre d'identificateurs utilisés : 123
Taille maximum du répertoire : 300
Pourcentage d'utilisation du répertoire : 41 %


Fermeture de la base

Nom de la base : ELEMBASE
Nombre d'enregistrements utilisés : 24
Nombre d'enregistrements maximum : 512
Longueur d'enregistrement (octets) : 819200
Nombre total d'accès en lecture : 49
Volume des accès en lecture : 38.28 Mo.
Nombre total d'accès en écriture : 3
Volume des accès en écriture : 2.34 Mo.
Nombre d'identificateurs utilisés : 123
Taille maximum du répertoire : 300
Pourcentage d'utilisation du répertoire : 41 %

Relecture des catalogues des éléments faite.

fin de lecture (durée 0.020000 s.)
# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 15.04 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0001 user+syst: 0.05s (syst: 0.01s, elaps: 0.04s)
#

#
# Commande No : 0002 Concept de type : mater_sdaster
#
MA=DEFI_MATERIAU(INFO=1,
ELAS=_F(E=2.E5,
NU=0.29999999999999999),
);


MATERIAU : MA
RELATION DE COMPORTEMENT: ELAS


# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 15.04 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0002 user+syst: 0.01s (syst: 0.00s, elaps: 0.02s)
#

#
# Commande No : 0003 Concept de type : maillage_sdaster
#
MAIL=LIRE_MAILLAGE(INFO=1,
INFO_MED=1,
VERI_MAIL=_F(APLAT=1.E-3,
VERIF='OUI'),
UNITE=20,
FORMAT='MED',
);

====== VERIFICATION DU MAILLAGE ======


MAILLAGE MAIL - IMPRESSIONS NIVEAU 1

JE-16-MAI -2013 11:23:49

NOMBRE DE NOEUDS 256

NOMBRE DE MAILLES 142
SEG3 29
TRIA6 113

NOMBRE DE GROUPES DE NOEUDS 5
A 1
B 1
D 1
F 1
G 1

NOMBRE DE GROUPES DE MAILLES 5
trou 5
gauche 9
droite 4
bas 9
haut 2


# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 15.04 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0003 user+syst: 0.04s (syst: 0.01s, elaps: 0.04s)
#

#
# Commande No : 0004 Concept de type : modele_sdaster
#
MODE=AFFE_MODELE(MAILLAGE=MAIL,
INFO=1,
AFFE=_F(PHENOMENE='MECANIQUE',
TOUT='OUI',
MODELISATION='C_PLAN'),
PARTITION=_F(PARALLELISME='GROUP_ELEM'),
VERI_JACOBIEN='OUI',
);


SUR LES 142 MAILLES DU MAILLAGE MAIL
ON A DEMANDE L'AFFECTATION DE 142
ON A PU EN AFFECTER 142

MODELISATION ELEMENT FINI TYPE MAILLE NOMBRE
C_PLAN MECPTR6 TRIA6 113
MEPLSE3 SEG3 29

#2 Calculs elementaires et assemblages CPU (USER+SYST/SYST/ELAPS): 0.00 0.00 0.00
# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 21.35 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0004 user+syst: 0.11s (syst: 0.01s, elaps: 0.10s)
#

#
# Commande No : 0005 Concept de type : maillage_sdaster
#
MAIL=MODI_MAILLAGE(reuse = MAIL,
MAILLAGE=MAIL,
ORIE_PEAU_2D=_F(GROUP_MA='haut'),
INFO=1,
);

TRAITEMENT DU GROUP_MA: haut DE 2 MAILLES
2 MAILLE(S) ONT ETE ORIENTEE(S)
AU TOTAL 2 MAILLE(S) ORIENTEE(S)
# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 21.35 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0005 user+syst: 0.02s (syst: 0.00s, elaps: 0.02s)
#

#
# Commande No : 0006 Concept de type : cham_mater
#
MATE=AFFE_MATERIAU(INFO=1,
MAILLAGE=MAIL,
AFFE=_F(MATER=MA,
TOUT='OUI'),
);

# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 21.35 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0006 user+syst: 0.04s (syst: 0.00s, elaps: 0.04s)
#

#
# Commande No : 0007 Concept de type : char_meca
#
CHAR=AFFE_CHAR_MECA(INFO=1,
DDL_IMPO=(_F(GROUP_MA='bas',
DY=0.0),
_F(GROUP_MA='gauche',
DX=0.0)),
PRES_REP=_F(GROUP_MA='haut',
PRES=-100.0),
LIAISON_XFEM='NON',
VERI_NORM='OUI',
MODELE=MODE,
);

# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 21.35 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0007 user+syst: 0.10s (syst: 0.00s, elaps: 0.10s)
#

#
# Commande No : 0008 Concept de type : evol_elas
#
RESU=MECA_STATIQUE(EXCIT=_F(TYPE_CHARGE='FIXE',
CHARGE=CHAR),
INFO=1,
OPTION='SIEF_ELGA',
SOLVEUR=_F(RENUM='METIS',
STOP_SINGULIER='OUI',
METHODE='MULT_FRONT',
NPREC=8),
INST=0.0,
MODELE=MODE,
CHAM_MATER=MATE,
);


Le système linéaire à résoudre contient 332 noeuds dont:
- 256 noeuds portant des degrés de liberté physiques
- 76 noeuds portant des degrés de liberté de Lagrange
Pour un total de 588 équations.

La matrice est de taille 588 équations.
Mais elle contient:
- 5954 termes non nuls si elle est symétrique (soit un taux de remplissage de 3.44e+00 %)
- 11320 termes non nuls si elle n'est pas symétrique (soit un taux de remplissage de 3.27e+00 %)
Le nombre de termes non nuls est susceptible de varier si l'on utilise le contact en méthode continue
ou la méthode XFEM avec contact.
CHAMP STOCKE : DEPL INSTANT : 0.00000E+00 NUMERO D'ORDRE : 1
#1 Resolution des systemes lineaires CPU (USER+SYST/SYST/ELAPS): 0.00 0.00 0.03
#2 Calculs elementaires et assemblages CPU (USER+SYST/SYST/ELAPS): 0.02 0.00 0.01
# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 21.35 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0008 user+syst: 0.06s (syst: 0.00s, elaps: 0.10s)
#

#
# Commande No : 0009 Concept de type : evol_elas
#
RESU=CALC_ELEM(reuse = RESU,
INFO=1,
CRITERE='RELATIF',
OPTION=('SIGM_ELNO','SIEQ_ELNO','SIEQ_ELGA',),
TYPE_OPTION='TOUTES',
SOLVEUR=_F(RENUM='METIS',
STOP_SINGULIER='OUI',
METHODE='MULT_FRONT',
NPREC=8),
PRECISION=9.9999999999999995E-07,
RESULTAT=RESU,
);

#2 Calculs elementaires et assemblages CPU (USER+SYST/SYST/ELAPS): 0.00 0.00 0.01
# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 21.50 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0009 user+syst: 0.07s (syst: 0.01s, elaps: 0.06s)
#

#
# Commande No : 0010 Concept de type : evol_elas
#
RESU=CALC_CHAMP(reuse = RESU,
INFO=1,
CRITERE='RELATIF',
CRITERES='SIEQ_NOEU',
PRECISION=9.9999999999999995E-07,
CONTRAINTE='SIGM_NOEU',
RESULTAT=RESU,
);

# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 21.50 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0010 user+syst: 0.05s (syst: 0.00s, elaps: 0.05s)
#

#
# Commande No : 0011 Concept de type : -
#
IMPR_RESU(INFO=1,
RESU=_F(MAILLAGE=MAIL,
INFO_MAILLAGE='NON',
RESULTAT=RESU,
NOM_CHAM=('DEPL','SIGM_NOEU','SIEQ_NOEU','SIEQ_ELGA',)),
UNITE=80,
FORMAT='MED',
);

# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 21.50 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0011 user+syst: 0.02s (syst: 0.00s, elaps: 0.03s)
#

#
# Commande No : 0012 Concept de type : -
#
TEST_RESU(TEST_NAN='NON',
RESU=(_F(CRITERE='RELATIF',
NUME_ORDRE=1,
REFERENCE='ANALYTIQUE',
NOM_CMP='SIYY',
GROUP_NO='B',
PRECISION=0.050000000000000003,
VALE=303.0,
RESULTAT=RESU,
NOM_CHAM='SIGM_NOEU',
VALE_ABS='NON'),
_F(CRITERE='RELATIF',
NUME_ORDRE=1,
REFERENCE='NON_REGRESSION',
NOM_CMP='SIYY',
GROUP_NO='B',
PRECISION=9.9999999999999995E-08,
VALE=289.52122500000002,
RESULTAT=RESU,
NOM_CHAM='SIGM_NOEU',
VALE_ABS='NON')),
);

# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 21.50 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0012 user+syst: 0.01s (syst: 0.00s, elaps: 0.00s)
#

#
# Commande No : 0013 Concept de type : -
#
TEST_RESU(TEST_NAN='NON',
RESU=(_F(CRITERE='RELATIF',
NUME_ORDRE=1,
REFERENCE='ANALYTIQUE',
NOM_CMP='SIXX',
GROUP_NO='A',
PRECISION=0.14999999999999999,
VALE=-100.0,
RESULTAT=RESU,
NOM_CHAM='SIGM_NOEU',
VALE_ABS='NON'),
_F(CRITERE='RELATIF',
NUME_ORDRE=1,
REFERENCE='NON_REGRESSION',
NOM_CMP='SIXX',
GROUP_NO='A',
PRECISION=9.9999999999999995E-08,
VALE=-85.881414500000005,
RESULTAT=RESU,
NOM_CHAM='SIGM_NOEU',
VALE_ABS='NON')),
);

# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 21.50 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0013 user+syst: 0.00s (syst: 0.00s, elaps: 0.00s)
#

#
# Commande No : 0014 Concept de type : -
#
FIN(RETASSAGE='NON',
INFO_RESU='OUI',
FORMAT_HDF='NON',
UNITE=6,
);


!
!
! <I> <CATAMESS_89> !
! !
! Liste des alarmes émises lors de l'exécution du calcul. !
! !
! Les alarmes que vous avez choisies d'ignorer sont précédées de (*). !
! Nombre d'occurrences pour chacune des alarmes : !
! aucune alarme !
!
!


======>

STRUCTURE DU CONCEPT RESU CALCULE POUR 1 NUMERO D'ORDRE

LISTE DES NOMS SYMBOLIQUES:
!
!
!
!
!
!
!
!
!
! NUME_ORDRE ! DEPL ! SIEF_ELGA ! SIGM_ELNO ! SIGM_NOEU ! SIEQ_ELGA ! SIEQ_ELNO ! SIEQ_NOEU !
!
!
!
!
!
!
!
!
!
! 1 ! DEPL_R ! SIEF_R ! SIEF_R ! SIEF_R ! SIEF_R ! SIEF_R ! SIEF_R !
!
!
!
!
!
!
!
!
!

LISTE DES NOMS DE VARIABLES D'ACCES:
INST DE TYPE R

LISTE DES NOMS DE PARAMETRES:
!
!
!
!
!
!
!
!
!
!
! NUME_ORDRE ! CARAELEM ! CHAMPMAT ! EXCIT ! ITER_GCPC ! METHODE ! MODELE ! RENUM ! STOCKAGE !
!
!
!
!
!
!
!
!
!
!
! 1 ! K8 ! K8 ! K24 ! I ! K16 ! K8 ! K16 ! K16 !
!
!
!
!
!
!
!
!
!
!
Concepts de la base: G
Nom Type Taille (Mo) Nombre Nombre de
d'objets segments
TOTAL 15.97 169 309

MA MATER_SDASTER 0.00 4 4
MAIL MAILLAGE_SDASTER 0.03 35 66
MODE MODELE_SDASTER 0.02 8 13
MATE CHAM_MATER 0.00 5 10
CHAR CHAR_MECA 0.02 24 49
RESU EVOL_ELAS 0.31 47 60
&FOZERO 0.00 2 2
&&_NUM_C 0.00 1 1
&&SYS.KR 0.04 1 1
&CATA.AC 0.00 2 4
&CATA.CL 0.25 1 3
&CATA.GD 0.04 4 11
&CATA.ME 0.13 2 4
&CATA.OP 0.32 4 19
&CATA.PH 0.00 1 1
&CATA.PR 0.00 2 4
&CATA.TE 14.80 17 42
&CATA.TH 0.01 2 4
&CATA.TM 0.02 7 11


Fermeture de la base

Nom de la base : GLOBALE
Nombre d'enregistrements utilisés : 27
Nombre d'enregistrements maximum : 62914
Longueur d'enregistrement (octets) : 819200
Nombre total d'accès en lecture : 7
Volume des accès en lecture : 5.47 Mo.
Nombre total d'accès en écriture : 41
Volume des accès en écriture : 32.03 Mo.
Nombre d'identificateurs utilisés : 319
Taille maximum du répertoire : 2000
Pourcentage d'utilisation du répertoire : 15 %


Fermeture de la base

Nom de la base : VOLATILE
Nombre d'enregistrements utilisés : 3
Nombre d'enregistrements maximum : 62914
Longueur d'enregistrement (octets) : 819200
Nombre total d'accès en lecture : 0
Volume des accès en lecture : 0.00 Mo.
Nombre total d'accès en écriture : 4
Volume des accès en écriture : 3.12 Mo.
Nombre d'identificateurs utilisés : 715
Taille maximum du répertoire : 2000
Pourcentage d'utilisation du répertoire : 35 %

<FIN> Arrêt normal dans "FIN".

<I> FERMETURE DES BASES EFFECTUEE

STATISTIQUES CONCERNANT L'ALLOCATION DYNAMIQUE :
TAILLE CUMULEE MAXIMUM : 28 Mo.
TAILLE CUMULEE LIBEREE : 62 Mo.
NOMBRE TOTAL D'ALLOCATIONS : 37435
NOMBRE TOTAL DE LIBERATIONS : 37435
APPELS AU MECANISME DE LIBERATION : 0
TAILLE MEMOIRE CUMULEE RECUPEREE : 0 Mo.
VOLUME DES LECTURES : 0 Mo.
VOLUME DES ECRITURES : 0 Mo.

MEMOIRE JEVEUX MINIMALE REQUISE POUR L'EXECUTION : 21.50 Mo
- IMPOSE DE NOMBREUX ACCES DISQUE
- RALENTIT LA VITESSE D'EXECUTION
MEMOIRE JEVEUX OPTIMALE REQUISE POUR L'EXECUTION : 27.61 Mo
- LIMITE LES ACCES DISQUE
- AMELIORE LA VITESSE D'EXECUTION
MAXIMUM DE MEMOIRE UTILISEE PAR LE PROCESSUS : 213.32 Mo
- COMPREND LA MEMOIRE CONSOMMEE PAR JEVEUX,
LE SUPERVISEUR PYTHON, LES LIBRAIRIES EXTERNES

<I> FIN D'EXECUTION LE : JE-16-MAI -2013 11:23:49
# Statistiques mémoire (Mo) : 213.32 / 27.61 / 21.50 (VmPeak / Optimum / Minimum)
# Fin commande No : 0014 user+syst: 0.04s (syst: 0.03s, elaps: 0.04s)
#


<I> Informations sur les temps d'exécution
Temps cpu total 1.26 s
Temps cpu user total 1.16 s
Temps cpu systeme total 0.10 s
Temps cpu restant 48.74 s

EXECUTION_CODE_ASTER_EXIT_16777=0
<INFO> Code_Aster run ended, diagnostic : OK

Content of /tmp/root-HP-8540w-interactif.16008 after execution

.:
total 42884
drwx
5 root root 4096 May 16 11:23 .
drwxrwxrwt 18 root root 4096 May 16 11:23 ..
-rw-r--r-- 1 root root 717 May 16 11:23 16777.export
-rw-r--r-- 1 root root 46 May 16 11:23 16777.para
lrwxrwxrwx 1 root root 77 May 16 11:23 asteru -> /home/.../System/ProgramFiles/SALOME-MECA-2012.2-LGPL/aster/testing/asteru
-rw-r--r-- 1 root root 7249 May 16 11:23 config.txt
-rw-r--r-- 1 root root 19660808 May 16 11:23 elem.1
-rw-r--r-- 1 root root 3990 May 16 11:23 fort.1
-rw-r--r-- 1 root root 3990 May 16 11:23 fort.1.1
-rw-r--r-- 1 root root 11934 May 16 11:23 fort.15
-rw-r--r-- 1 root root 78561 May 16 11:23 fort.20
-rw-r--r-- 1 root root 31184 May 16 11:23 fort.6
-rw-r--r-- 1 root root 6270 May 16 11:23 fort.8
-rw-r--r-- 1 root root 121598 May 16 11:23 fort.80
-rw-r--r-- 1 root root 2017 May 16 11:23 fort.9
-rw-r--r-- 1 root root 8041 May 16 11:23 fort.98
-rw-r--r-- 1 root root 22654 May 16 11:23 fort.99
-rw-r--r-- 1 root root 22118408 May 16 11:23 glob.1
-rw-r--r-- 1 root root 44 May 16 11:23 info_cpu
-rw-r--r-- 1 root root 128550 May 16 11:23 pick.1
drwxr-xr-x 21 root root 4096 May 16 11:23 Python
drwxr-xr-x 2 root root 4096 May 16 11:23 REPE_OUT
drwxr-xr-x 2 root root 4096 May 16 11:23 RESU_ENSIGHT
-rw-r--r-- 1 root root 2457608 May 16 11:23 vola.1

REPE_OUT:
total 8
drwxr-xr-x 2 root root 4096 May 16 11:23 .
drwx
5 root root 4096 May 16 11:23 ..


Size of bases

<INFO> size of vola.1 : 2457608 bytes
<INFO> size of glob.1 : 22118408 bytes
<INFO> size of pick.1 : 128550 bytes

Copying results

copying .../fort.6... [ OK ]
copying .../fort.8... [ OK ]
copying .../fort.9... [ OK ]

OK Code_Aster run ended


Content of RESU file



-- CODE_ASTER -- VERSION : DÉVELOPPEMENT STABILISÉE (testing) --

Version 11.2.0 du 06/06/2012
Copyright EDF R&D 1991 - 2013
Exécution du : Thu May 16 11:23:49 2013
Nom de la machine : HP-8540w
Architecture : 64bit
Type de processeur : x86_64
Système d'exploitation : Linux 3.2.0-43-generic
Langue des messages : en (UTF-8)

Parallélisme MPI : inactif
Parallélisme OpenMP : actif
Nombre de processus utilisés : 1
Version de la librairie HDF5 : 1.8.8
Version de la librairie MED : 3.0.5
Librairie MUMPS : installée
Version de la librairie SCOTCH : 5.1.10
Limite de la mémoire dynamique : 64.00 Mo
Taille limite des fichiers d'échange : 48.00 Go


---- RESULTAT NUME_ORDRE NOM_CHAM NOM_CMP GROUP_NO
RESU 1 SIGM_NOEU SIYY B
REFERENCE LEGENDE VALE_REF VALE_CAL ERREUR TOLE
OK ANALYTIQUE XXXX 303.0 289.52122552227 4.45% 5.0%

---- RESULTAT NUME_ORDRE NOM_CHAM NOM_CMP GROUP_NO
RESU 1 SIGM_NOEU SIYY B
REFERENCE LEGENDE VALE_REF VALE_CAL ERREUR TOLE
OK NON_REGRESSION XXXX 289.521225 289.52122552227 1.8E-07% 1.0E-05%


---- RESULTAT NUME_ORDRE NOM_CHAM NOM_CMP GROUP_NO
RESU 1 SIGM_NOEU SIXX A
REFERENCE LEGENDE VALE_REF VALE_CAL ERREUR TOLE
OK ANALYTIQUE XXXX -100.0 -85.881414506285 14.1% 15.0%

---- RESULTAT NUME_ORDRE NOM_CHAM NOM_CMP GROUP_NO
RESU 1 SIGM_NOEU SIXX A
REFERENCE LEGENDE VALE_REF VALE_CAL ERREUR TOLE
OK NON_REGRESSION XXXX -85.8814145 -85.881414506285 7.32E-09% 1.0E-05%

<I> <FIN> FERMETURE DE LA BASE "GLOBALE" EFFECTUEE.

<FIN> Arrêt normal dans "FIN".
<I> <FIN> ARRET NORMAL DANS "FIN" PAR APPEL A "JEFINI".

<I> <FIN> MEMOIRE JEVEUX MINIMALE REQUISE POUR L'EXECUTION : 21.50 Mo
<I> <FIN> MEMOIRE JEVEUX OPTIMALE REQUISE POUR L'EXECUTION : 27.61 Mo
<I> <FIN> MAXIMUM DE MEMOIRE UTILISEE PAR LE PROCESSUS LORS DE L'EXECUTION : 213.32 Mo

********************************************************************************
* COMMAND : USER : SYSTEM : USER+SYS : ELAPSED *
********************************************************************************
* init (jdc) : 0.61 : 0.03 : 0.64 : 0.64 *
* . compile : 0.01 : 0.00 : 0.01 : 0.00 *
* . exec_compile : 0.07 : 0.01 : 0.08 : 0.09 *
* . report : 0.01 : 0.00 : 0.01 : 0.00 *
* . build : 0.00 : 0.00 : 0.00 : 0.00 *
* DEBUT : 0.04 : 0.01 : 0.05 : 0.04 *
* DEFI_MATERIAU : 0.01 : 0.00 : 0.01 : 0.02 *
* LIRE_MAILLAGE : 0.03 : 0.01 : 0.04 : 0.04 *
* AFFE_MODELE : 0.10 : 0.01 : 0.11 : 0.10 *
* MODI_MAILLAGE : 0.02 : 0.00 : 0.02 : 0.02 *
* AFFE_MATERIAU : 0.04 : 0.00 : 0.04 : 0.04 *
* AFFE_CHAR_MECA : 0.10 : 0.00 : 0.10 : 0.10 *
* MECA_STATIQUE : 0.06 : 0.00 : 0.06 : 0.10 *
* CALC_ELEM : 0.06 : 0.01 : 0.07 : 0.06 *
* CALC_CHAMP : 0.05 : 0.00 : 0.05 : 0.05 *
* IMPR_RESU : 0.02 : 0.00 : 0.02 : 0.03 *
* TEST_RESU : 0.01 : 0.00 : 0.01 : 0.00 *
* TEST_RESU : 0.00 : 0.00 : 0.00 : 0.00 *
* FIN : 0.01 : 0.03 : 0.04 : 0.04 *
* . part Superviseur : 1.05 : 0.07 : 1.12 : 1.14 *
* . sdveri : 0.38 : 0.03 : 0.41 : 0.41 *
* . part Fortran : 0.11 : 0.03 : 0.14 : 0.15 *
********************************************************************************
* TOTAL_JOB : 1.16 : 0.10 : 1.26 : 1.30 *
********************************************************************************


Content of ERROR file



-- CODE_ASTER -- VERSION : DÉVELOPPEMENT STABILISÉE (testing) --

Version 11.2.0 du 06/06/2012
Copyright EDF R&D 1991 - 2013
Exécution du : Thu May 16 11:23:49 2013
Nom de la machine : HP-8540w
Architecture : 64bit
Type de processeur : x86_64
Système d'exploitation : Linux 3.2.0-43-generic
Langue des messages : en (UTF-8)

Parallélisme MPI : inactif
Parallélisme OpenMP : actif
Nombre de processus utilisés : 1
Version de la librairie HDF5 : 1.8.8
Version de la librairie MED : 3.0.5
Librairie MUMPS : installée
Version de la librairie SCOTCH : 5.1.10
Limite de la mémoire dynamique : 64.00 Mo
Taille limite des fichiers d'échange : 48.00 Go

<I> <FIN> FERMETURE DE LA BASE "GLOBALE" EFFECTUEE.

<FIN> Arrêt normal dans "FIN".
<I> <FIN> ARRET NORMAL DANS "FIN" PAR APPEL A "JEFINI".


cpu system cpu+sys elapsed
Preparation of environment 0.01 0.05 0.06 0.07
Copying datas 0.00 0.01 0.01 0.03
Code_Aster run 1.43 0.17 1.60 1.62
Copying results 0.01 0.01 0.02 0.03
Total 1.49 0.29 1.78 1.92

as_run 1.10.5

--- DIAGNOSTIC JOB : OK


EXIT_CODE=0
= end output 2 ==================================================================================
Last edit: 10 years 11 months ago by dutchtallman.

Please Log in or Create an account to join the conversation.

More
10 years 11 months ago #6908 by dutchtallman
Replied by dutchtallman on topic Re: CAELinux 2013: development and testing
I could not add a new ticket on sourceforge on the above ...

Please Log in or Create an account to join the conversation.

  • Joël Cugnoni
  • Joël Cugnoni's Avatar Topic Author
  • Offline
  • Moderator
  • Moderator
More
10 years 11 months ago #6909 by Joël Cugnoni
Replied by Joël Cugnoni on topic Re: CAELinux 2013: development and testing
Thanks for reporting this issue;

actually, the error in the 1st test run is "normal" as you need to source the Salome-Meca environment if you want to run command line tools such "as_run" directly. This is the case for all versions of Salome-meca packages until now. For version, you can source the environment by running:
[code]
source /opt/SALOME-MECA-2013.1/SALOME-MECA-2013.1-LGPL/salome_prerequisites.sh
[/code ]
(before running any shell command involving Aster)

For sourceforge tickets, I have to still to find the reason why.. but i will try to enable this asap

Joël Cugnoni - a.k.a admin
www.caelinux.com

Please Log in or Create an account to join the conversation.

More
10 years 11 months ago #6910 by John Hazel
Replied by John Hazel on topic Re: CAELinux 2013: development and testing
I tried installing the MATE desktop on top of Xubuntu 12.04.2 LTS
mate-desktop.org/

Here are the instructions I followed:
wiki.mate-desktop.org/download

This sets up the option to choose either xfce or MATE at the initial login.
(if you installed using auto login on Xubuntu 12.04.2 the choice will not be offered though)

MATE works nearly identical to the desktop of CAElinux 2011.
MATE seems to be less buggy than xfce.

Please Log in or Create an account to join the conversation.

Moderators: catux
Time to create page: 0.170 seconds
Powered by Kunena Forum